10 consejos para un mejor software (de) científico(s)

Quién soy

• Compañero de Nati, Zamba y Minou
• Hincha de Boca y del dulce de leche
• Ingeniero en Computación (UNC)
• Pythonista desde 2007
• Emprendedor en @Phasety
• Trabajo con químicos que programan

Sobre esta charla

De un hombre de software, a los hombres y mujeres de la academia, con respeto y cariño.

Also Known As:

catarsis | solidaridad | pedido de auxilio

En general ¿qué hace el software (de) científico(s)?

• Herramienta de exploración de problemas
• Nicho muy específico
• Modelado numérico / simulación
• Manipulación de datos
• Gráficos

Problemas comunes

• Ciclo prueba-error-corrección lento
• Documentación escasa
• Múltiples herramientas para lograr un resultado
• Limitaciones de scope del lenguaje ("no escala")
• ¿Pirata yo?

Y sobre todo...

Inercia académica

No sigas las huellas de tus maestros. Busca lo que ellos buscaron.

Consejo 1:

Pare de sufrir

#EsPregunta

¿Les cobran por vocal?

DIMENSION FGx(2),FGy(2),FGTx(2),FGTy(2),FGVx(2),FGVy(2)
DIMENSION DFGNx(2,2),DFGNy(2,2)
DIMENSION DPDNx(2),DPDNy(2),XOLD(5),OLD(5)

Consejo 2:

Programe para humanos

Programs must be written for people to read, and only incidentally for machines to execute.

Ésta la conozco

From: Juan <subdito@todavianosegit.edu>
To: Dr. God <sersuperior@todavianosegit.edu>
Subject: Trabajo

Doctor, acá le mando el zip con la última versión
que incluye mi parte del paper

----

From: Dr. God <sersuperior@todavianosegit.edu>
To: Juan <subdito@todavianosegit.edu>
Subject: Re: Trabajo

Estimado Juan me olvidé de avisarle que María modificó esa parte
y cambiaron los parámetros de la función.
Por favor, revise el último código que le adjunto.

Ésta también

Consejo 3:

Usá control de versiones

• Cambios incrementales
• Trabajo colaborativo: qué, quién, cuándo (para qué)
• Branchs: libertad para experimentar
• Backups
• Dropbox no es una solución

Ay, ¡los inputs!

1
0 0
CARBON DIOXIDE
304.21  73.83  0.22362  0.114197
3.7042  0.029682  0.823228
ETHANE
305.32  48.72  0.09949  0.173685
5.6544  0.045144  0.634870
0.0
0.0
200.0

Consejo 4:

La interactividad es poder!

Si no queda otra (configuración):

• Usá estándares: por ejemplo json o YAML.
• Dale semántica a los datos

"Simple is better than complex.

Explicit is better than implicit"

Efecto model2param.for

Consejo 5:

Don't Repeat Yourself

Bienvenidos al código (de un) científico

Consejo 6:

¡Modularizá!

La mochila de los parámetros

CALL SUP(x1,y1,x2,y2, sup_out)
CALL PER(x1,y1,x2,y2, per_out)

Consejo 7:

Programá tan alto como puedas

class Rectangulo(object):

    def __init__(self, punto1, prunto2):
        self.punto1 = punto1
        self.punto2 = punto2

    def superficie(self):
        return abs((self.punto1.x - self.punto2.x) *
                   (self.punto1.y - self.punto2.y))

    def perimetro(self):
        ...

¡A tu grandeza, Newton!

subroutine mi_newton(f, fp, x0, x, iters, debug)

    !esta funcion implementa el metodo de Newton para
    !encontrar el 0 de una función f

Really?

Consejo 8:

No reinventes la rueda

If I have seen further it is by standing on the shoulders of giants.

Tip: scipy.optimize.newton

Hacer software no es sólo escribir código

Atenti:

Consejo 9:

documentar!

Probar programas es agotador

Consejo 10:

que la computadora trabaje por vos

def test_suma():
    assert suma(2, 2) == 4

Los tests te dan seguridad

Una más ?

Intentá siempre,

siempre,

aprender más

Consejo de yapa:

vení mañana

Muchas gracias